Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PEX2P28328 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PEX2P28328 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX2P28328 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX2P28328 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX2P28328 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX2P28328 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX2P28328 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX2P28328 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX2P28328 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX2P28328 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PEX2P28328 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PEX2P28328 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PEX2P28328 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PEX2P28328 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PEX2P28328 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PEX2P28328 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX2P28328 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX2P28328 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX2P28328 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX2P28328 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX2P28328 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX2P28328 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PEX2P28328 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PEX2P28328 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEX2P28328 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEX2P28328 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEX2P28328 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEX2P28328 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEX2P28328 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PEX2P28328 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX2P28328 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX2P28328 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX2P28328 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX2P28328 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PEX2P28328 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms