Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PSMB5P28074 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB5P28074 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms