Protein–RNA interactions for Protein: P27824

CANX, Calnexin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CANXP27824 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CANXP27824 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CANXP27824 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CANXP27824 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CANXP27824 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CANXP27824 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CANXP27824 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CANXP27824 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CANXP27824 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CANXP27824 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CANXP27824 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CANXP27824 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CANXP27824 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CANXP27824 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CANXP27824 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CANXP27824 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CANXP27824 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CANXP27824 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CANXP27824 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CANXP27824 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CANXP27824 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CANXP27824 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CANXP27824 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CANXP27824 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CANXP27824 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CANXP27824 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CANXP27824 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CANXP27824 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CANXP27824 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CANXP27824 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CANXP27824 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CANXP27824 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CANXP27824 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CANXP27824 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CANXP27824 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CANXP27824 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CANXP27824 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CANXP27824 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CANXP27824 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CANXP27824 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CANXP27824 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms