Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTFP26441 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTFP26441 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTFP26441 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTFP26441 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTFP26441 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTFP26441 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFP26441 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFP26441 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFP26441 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFP26441 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFP26441 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFP26441 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFP26441 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTFP26441 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTFP26441 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTFP26441 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTFP26441 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNTFP26441 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTFP26441 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTFP26441 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTFP26441 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTFP26441 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTFP26441 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTFP26441 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTFP26441 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNTFP26441 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms