Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKCHP24723 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
PRKCHP24723 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCHP24723 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCHP24723 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCHP24723 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCHP24723 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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