Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCND1P24385 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCND1P24385 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCND1P24385 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCND1P24385 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCND1P24385 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCND1P24385 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCND1P24385 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCND1P24385 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCND1P24385 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND1P24385 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND1P24385 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND1P24385 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND1P24385 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND1P24385 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND1P24385 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCND1P24385 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCND1P24385 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCND1P24385 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCND1P24385 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCND1P24385 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms