Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EIF4BP23588 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EIF4BP23588 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms