Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA6P23229 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
ITGA6P23229 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ITGA6P23229 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA6P23229 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA6P23229 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA6P23229 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA6P23229 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA6P23229 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA6P23229 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ITGA6P23229 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA6P23229 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA6P23229 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA6P23229 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA6P23229 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA6P23229 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA6P23229 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA6P23229 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA6P23229 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA6P23229 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA6P23229 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA6P23229 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA6P23229 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA6P23229 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA6P23229 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA6P23229 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA6P23229 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA6P23229 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA6P23229 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGA6P23229 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ITGA6P23229 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA6P23229 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA6P23229 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA6P23229 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
ITGA6P23229 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ITGA6P23229 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
ITGA6P23229 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA6P23229 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms