Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP8P22894 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP8P22894 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP8P22894 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP8P22894 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP8P22894 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP8P22894 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP8P22894 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP8P22894 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP8P22894 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP8P22894 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP8P22894 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP8P22894 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP8P22894 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP8P22894 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP8P22894 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP8P22894 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP8P22894 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP8P22894 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP8P22894 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP8P22894 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP8P22894 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP8P22894 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP8P22894 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms