Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASTP20810 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CASTP20810 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CASTP20810 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CASTP20810 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASTP20810 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASTP20810 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASTP20810 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASTP20810 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASTP20810 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASTP20810 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CASTP20810 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CASTP20810 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CASTP20810 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CASTP20810 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASTP20810 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASTP20810 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASTP20810 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASTP20810 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASTP20810 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASTP20810 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASTP20810 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CASTP20810 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CASTP20810 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASTP20810 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASTP20810 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASTP20810 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASTP20810 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASTP20810 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CASTP20810 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CASTP20810 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASTP20810 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASTP20810 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASTP20810 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASTP20810 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASTP20810 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASTP20810 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASTP20810 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASTP20810 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CASTP20810 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CASTP20810 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASTP20810 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASTP20810 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CASTP20810 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASTP20810 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CASTP20810 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASTP20810 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CASTP20810 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CASTP20810 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CASTP20810 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms