Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP4AP20648 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP4AP20648 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP4AP20648 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms