Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NR1D1P20393 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D1P20393 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms