Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKB1P19838 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NFKB1P19838 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms