Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCAM1P19320 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
VCAM1P19320 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
VCAM1P19320 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms