Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPL17P18621 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPL17P18621 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL17P18621 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL17P18621 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL17P18621 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL17P18621 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL17P18621 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL17P18621 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL17P18621 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPL17P18621 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPL17P18621 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPL17P18621 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL17P18621 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL17P18621 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL17P18621 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL17P18621 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL17P18621 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL17P18621 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL17P18621 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPL17P18621 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL17P18621 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL17P18621 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL17P18621 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL17P18621 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL17P18621 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL17P18621 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL17P18621 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL17P18621 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL17P18621 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL17P18621 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL17P18621 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms