Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FLT1P17948 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FLT1P17948 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FLT1P17948 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FLT1P17948 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FLT1P17948 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FLT1P17948 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FLT1P17948 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FLT1P17948 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FLT1P17948 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FLT1P17948 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FLT1P17948 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FLT1P17948 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FLT1P17948 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FLT1P17948 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FLT1P17948 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FLT1P17948 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FLT1P17948 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FLT1P17948 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FLT1P17948 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FLT1P17948 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FLT1P17948 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FLT1P17948 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FLT1P17948 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FLT1P17948 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FLT1P17948 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FLT1P17948 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FLT1P17948 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FLT1P17948 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FLT1P17948 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FLT1P17948 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FLT1P17948 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FLT1P17948 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FLT1P17948 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FLT1P17948 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FLT1P17948 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FLT1P17948 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FLT1P17948 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FLT1P17948 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FLT1P17948 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms