Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CHRNB2P17787 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHRNB2P17787 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHRNB2P17787 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms