Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
UBTFP17480 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
UBTFP17480 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
UBTFP17480 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
UBTFP17480 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
UBTFP17480 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
UBTFP17480 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
UBTFP17480 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
UBTFP17480 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
UBTFP17480 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
UBTFP17480 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
UBTFP17480 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.09■■■■□ 3.37
UBTFP17480 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
UBTFP17480 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
UBTFP17480 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
UBTFP17480 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
UBTFP17480 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
UBTFP17480 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
UBTFP17480 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
UBTFP17480 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
UBTFP17480 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
UBTFP17480 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
UBTFP17480 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
UBTFP17480 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
UBTFP17480 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
UBTFP17480 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
UBTFP17480 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
UBTFP17480 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
UBTFP17480 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
UBTFP17480 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
UBTFP17480 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
UBTFP17480 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
UBTFP17480 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
UBTFP17480 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
UBTFP17480 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
UBTFP17480 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
UBTFP17480 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
UBTFP17480 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
UBTFP17480 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
UBTFP17480 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
UBTFP17480 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
UBTFP17480 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
UBTFP17480 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
UBTFP17480 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
UBTFP17480 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
UBTFP17480 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
UBTFP17480 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
UBTFP17480 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
UBTFP17480 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
UBTFP17480 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
UBTFP17480 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
UBTFP17480 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
UBTFP17480 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
UBTFP17480 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
UBTFP17480 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
UBTFP17480 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
UBTFP17480 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
UBTFP17480 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
UBTFP17480 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
UBTFP17480 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
UBTFP17480 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
UBTFP17480 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
UBTFP17480 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
UBTFP17480 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
UBTFP17480 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
UBTFP17480 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.99■■■■□ 3.35
UBTFP17480 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
UBTFP17480 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
UBTFP17480 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
UBTFP17480 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
UBTFP17480 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
UBTFP17480 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
UBTFP17480 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
UBTFP17480 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
UBTFP17480 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
UBTFP17480 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
UBTFP17480 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
UBTFP17480 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
UBTFP17480 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
UBTFP17480 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
UBTFP17480 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
UBTFP17480 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms