Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB1P16220 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB1P16220 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB1P16220 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB1P16220 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB1P16220 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB1P16220 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB1P16220 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CREB1P16220 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB1P16220 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB1P16220 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB1P16220 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB1P16220 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB1P16220 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB1P16220 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB1P16220 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB1P16220 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CREB1P16220 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB1P16220 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB1P16220 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB1P16220 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CREB1P16220 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CREB1P16220 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CREB1P16220 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB1P16220 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB1P16220 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB1P16220 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB1P16220 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB1P16220 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB1P16220 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB1P16220 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB1P16220 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CREB1P16220 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CREB1P16220 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CREB1P16220 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CREB1P16220 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB1P16220 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB1P16220 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB1P16220 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB1P16220 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB1P16220 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB1P16220 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB1P16220 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB1P16220 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CREB1P16220 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CREB1P16220 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms