Protein–RNA interactions for Protein: P16150

SPN, Leukosialin, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNP16150 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPNP16150 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPNP16150 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPNP16150 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPNP16150 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPNP16150 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPNP16150 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPNP16150 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPNP16150 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPNP16150 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPNP16150 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPNP16150 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPNP16150 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPNP16150 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPNP16150 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPNP16150 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPNP16150 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPNP16150 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPNP16150 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPNP16150 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPNP16150 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPNP16150 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPNP16150 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPNP16150 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPNP16150 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPNP16150 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPNP16150 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPNP16150 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPNP16150 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPNP16150 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPNP16150 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPNP16150 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPNP16150 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPNP16150 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPNP16150 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPNP16150 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPNP16150 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPNP16150 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPNP16150 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPNP16150 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPNP16150 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPNP16150 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPNP16150 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPNP16150 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPNP16150 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPNP16150 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPNP16150 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPNP16150 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPNP16150 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPNP16150 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPNP16150 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPNP16150 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPNP16150 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPNP16150 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPNP16150 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms