Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
MYOD1P15172 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms