Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GABRA1P14867 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GABRA1P14867 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms