Protein–RNA interactions for Protein: P13797

PLS3, Plastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLS3P13797 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLS3P13797 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PLS3P13797 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLS3P13797 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLS3P13797 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLS3P13797 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLS3P13797 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLS3P13797 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLS3P13797 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PLS3P13797 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLS3P13797 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLS3P13797 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLS3P13797 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLS3P13797 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLS3P13797 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLS3P13797 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLS3P13797 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLS3P13797 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PLS3P13797 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLS3P13797 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLS3P13797 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PLS3P13797 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLS3P13797 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PLS3P13797 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PLS3P13797 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PLS3P13797 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PLS3P13797 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PLS3P13797 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms