Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRG2P13727 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRG2P13727 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRG2P13727 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRG2P13727 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PRG2P13727 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRG2P13727 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRG2P13727 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRG2P13727 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PRG2P13727 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRG2P13727 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRG2P13727 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRG2P13727 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRG2P13727 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PRG2P13727 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PRG2P13727 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRG2P13727 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRG2P13727 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRG2P13727 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRG2P13727 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRG2P13727 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PRG2P13727 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PRG2P13727 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRG2P13727 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRG2P13727 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRG2P13727 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRG2P13727 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRG2P13727 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRG2P13727 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRG2P13727 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRG2P13727 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRG2P13727 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRG2P13727 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRG2P13727 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms