Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA4P13612 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA4P13612 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA4P13612 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms