Protein–RNA interactions for Protein: P12544

GZMA, Granzyme A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMAP12544 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GZMAP12544 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GZMAP12544 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GZMAP12544 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GZMAP12544 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GZMAP12544 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GZMAP12544 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GZMAP12544 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GZMAP12544 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GZMAP12544 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GZMAP12544 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GZMAP12544 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GZMAP12544 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GZMAP12544 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GZMAP12544 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GZMAP12544 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GZMAP12544 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GZMAP12544 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GZMAP12544 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GZMAP12544 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GZMAP12544 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GZMAP12544 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GZMAP12544 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GZMAP12544 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GZMAP12544 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GZMAP12544 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GZMAP12544 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GZMAP12544 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GZMAP12544 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GZMAP12544 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GZMAP12544 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GZMAP12544 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GZMAP12544 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GZMAP12544 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GZMAP12544 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GZMAP12544 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GZMAP12544 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GZMAP12544 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GZMAP12544 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GZMAP12544 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GZMAP12544 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GZMAP12544 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GZMAP12544 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GZMAP12544 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GZMAP12544 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GZMAP12544 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GZMAP12544 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GZMAP12544 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GZMAP12544 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms