Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COL11A1P12107 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COL11A1P12107 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms