Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CGB3P0DN86 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CGB3P0DN86 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms