Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM228BP0C875 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM228BP0C875 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM228BP0C875 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms