Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
C4BP0C0L5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
C4BP0C0L5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4BP0C0L5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms