Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPSAP08865 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPSAP08865 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPSAP08865 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPSAP08865 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPSAP08865 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPSAP08865 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPSAP08865 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPSAP08865 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPSAP08865 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPSAP08865 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPSAP08865 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RPSAP08865 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPSAP08865 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPSAP08865 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RPSAP08865 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPSAP08865 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPSAP08865 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RPSAP08865 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RPSAP08865 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RPSAP08865 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RPSAP08865 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RPSAP08865 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPSAP08865 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPSAP08865 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RPSAP08865 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPSAP08865 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPSAP08865 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RPSAP08865 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms