Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CSN3P07498 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSN3P07498 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSN3P07498 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSN3P07498 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSN3P07498 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSN3P07498 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSN3P07498 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CSN3P07498 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CSN3P07498 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CSN3P07498 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CSN3P07498 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CSN3P07498 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CSN3P07498 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms