Protein–RNA interactions for Protein: P04843

RPN1, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN1P04843 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPN1P04843 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPN1P04843 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN1P04843 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN1P04843 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN1P04843 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN1P04843 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN1P04843 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN1P04843 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN1P04843 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPN1P04843 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN1P04843 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN1P04843 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN1P04843 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN1P04843 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN1P04843 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN1P04843 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN1P04843 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPN1P04843 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPN1P04843 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPN1P04843 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN1P04843 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN1P04843 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN1P04843 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN1P04843 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN1P04843 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPN1P04843 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPN1P04843 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPN1P04843 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPN1P04843 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPN1P04843 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPN1P04843 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPN1P04843 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms