Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC4A1P02730 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A1P02730 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A1P02730 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms