Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNC2P02585 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNC2P02585 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1328.5 ms