Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMNAP02545 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMNAP02545 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMNAP02545 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNAP02545 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNAP02545 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNAP02545 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNAP02545 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNAP02545 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNAP02545 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMNAP02545 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNAP02545 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMNAP02545 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMNAP02545 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMNAP02545 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMNAP02545 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMNAP02545 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms