Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DRAP01903 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DRAP01903 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DRAP01903 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HLA-DRAP01903 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DRAP01903 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms