Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
IGKV1-17P01599 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
IGKV1-17P01599 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms