Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NSD2O96028 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NSD2O96028 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NSD2O96028 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
NSD2O96028 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NSD2O96028 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NSD2O96028 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
NSD2O96028 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NSD2O96028 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NSD2O96028 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSD2O96028 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSD2O96028 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSD2O96028 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSD2O96028 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSD2O96028 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NSD2O96028 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSD2O96028 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSD2O96028 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSD2O96028 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSD2O96028 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSD2O96028 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSD2O96028 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSD2O96028 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSD2O96028 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NSD2O96028 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSD2O96028 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSD2O96028 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSD2O96028 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NSD2O96028 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSD2O96028 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSD2O96028 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSD2O96028 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSD2O96028 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NSD2O96028 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NSD2O96028 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NSD2O96028 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NSD2O96028 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NSD2O96028 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NSD2O96028 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NSD2O96028 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NSD2O96028 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NSD2O96028 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NSD2O96028 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
NSD2O96028 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
NSD2O96028 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSD2O96028 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSD2O96028 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSD2O96028 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSD2O96028 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
NSD2O96028 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSD2O96028 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NSD2O96028 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSD2O96028 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSD2O96028 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSD2O96028 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSD2O96028 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSD2O96028 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSD2O96028 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NSD2O96028 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSD2O96028 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSD2O96028 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSD2O96028 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSD2O96028 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
NSD2O96028 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSD2O96028 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSD2O96028 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NSD2O96028 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSD2O96028 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSD2O96028 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSD2O96028 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSD2O96028 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSD2O96028 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSD2O96028 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NSD2O96028 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSD2O96028 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSD2O96028 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSD2O96028 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSD2O96028 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSD2O96028 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSD2O96028 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NSD2O96028 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSD2O96028 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NSD2O96028 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSD2O96028 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSD2O96028 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NSD2O96028 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSD2O96028 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NSD2O96028 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NSD2O96028 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NSD2O96028 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms