Protein–RNA interactions for Protein: O95922

TTLL1, Probable tubulin polyglutamylase TTLL1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL1O95922 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TTLL1O95922 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TTLL1O95922 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TTLL1O95922 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms