Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX58O95786 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX58O95786 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX58O95786 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX58O95786 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX58O95786 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX58O95786 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX58O95786 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX58O95786 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX58O95786 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX58O95786 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX58O95786 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX58O95786 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX58O95786 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX58O95786 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DDX58O95786 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX58O95786 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX58O95786 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX58O95786 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX58O95786 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX58O95786 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX58O95786 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX58O95786 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
DDX58O95786 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DDX58O95786 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX58O95786 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX58O95786 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX58O95786 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX58O95786 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX58O95786 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX58O95786 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
DDX58O95786 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDX58O95786 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
DDX58O95786 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX58O95786 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX58O95786 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX58O95786 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX58O95786 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX58O95786 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX58O95786 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX58O95786 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DDX58O95786 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX58O95786 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX58O95786 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX58O95786 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX58O95786 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX58O95786 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DDX58O95786 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX58O95786 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX58O95786 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX58O95786 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX58O95786 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX58O95786 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX58O95786 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX58O95786 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX58O95786 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DDX58O95786 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX58O95786 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX58O95786 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX58O95786 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX58O95786 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX58O95786 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX58O95786 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DDX58O95786 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX58O95786 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX58O95786 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX58O95786 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX58O95786 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DDX58O95786 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX58O95786 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX58O95786 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX58O95786 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX58O95786 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX58O95786 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX58O95786 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX58O95786 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DDX58O95786 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX58O95786 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX58O95786 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DDX58O95786 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms