Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX6O95503 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX6O95503 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX6O95503 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX6O95503 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CBX6O95503 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CBX6O95503 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX6O95503 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX6O95503 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX6O95503 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX6O95503 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX6O95503 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX6O95503 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CBX6O95503 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX6O95503 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX6O95503 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX6O95503 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX6O95503 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CBX6O95503 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CBX6O95503 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CBX6O95503 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CBX6O95503 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CBX6O95503 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CBX6O95503 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CBX6O95503 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms