Protein–RNA interactions for Protein: O95476

CTDNEP1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1O95476 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTDNEP1O95476 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTDNEP1O95476 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms