Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRATO95237 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRATO95237 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRATO95237 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRATO95237 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRATO95237 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRATO95237 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LRATO95237 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRATO95237 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRATO95237 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRATO95237 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRATO95237 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRATO95237 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRATO95237 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRATO95237 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRATO95237 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRATO95237 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRATO95237 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRATO95237 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRATO95237 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRATO95237 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRATO95237 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRATO95237 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRATO95237 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRATO95237 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRATO95237 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRATO95237 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRATO95237 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRATO95237 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRATO95237 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRATO95237 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms