Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDH8O95206 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDH8O95206 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms