Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN5O94779 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN5O94779 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 870 ms