Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM2O94769 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM2O94769 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM2O94769 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM2O94769 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM2O94769 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM2O94769 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM2O94769 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ECM2O94769 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM2O94769 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM2O94769 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ECM2O94769 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ECM2O94769 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM2O94769 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM2O94769 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM2O94769 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM2O94769 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM2O94769 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM2O94769 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM2O94769 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM2O94769 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM2O94769 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM2O94769 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM2O94769 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM2O94769 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM2O94769 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM2O94769 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ECM2O94769 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM2O94769 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM2O94769 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM2O94769 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM2O94769 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM2O94769 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM2O94769 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM2O94769 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM2O94769 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ECM2O94769 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM2O94769 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM2O94769 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM2O94769 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM2O94769 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM2O94769 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM2O94769 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM2O94769 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ECM2O94769 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM2O94769 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM2O94769 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM2O94769 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ECM2O94769 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ECM2O94769 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms