Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJB3O75712 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB3O75712 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GJB3O75712 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GJB3O75712 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GJB3O75712 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GJB3O75712 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB3O75712 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB3O75712 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB3O75712 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB3O75712 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB3O75712 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB3O75712 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GJB3O75712 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB3O75712 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB3O75712 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB3O75712 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB3O75712 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB3O75712 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB3O75712 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB3O75712 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GJB3O75712 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB3O75712 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB3O75712 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB3O75712 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB3O75712 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB3O75712 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB3O75712 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GJB3O75712 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB3O75712 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB3O75712 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GJB3O75712 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GJB3O75712 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB3O75712 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB3O75712 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB3O75712 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB3O75712 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB3O75712 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB3O75712 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB3O75712 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GJB3O75712 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GJB3O75712 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms