Protein–RNA interactions for Protein: O75508

CLDN11, Claudin-11, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11O75508 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN11O75508 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN11O75508 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms