Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRCH4O75427 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRCH4O75427 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms